История Белорусского профсоюза работников государственных и других учреждений начинается с 1931 года.
В марте 1931 года в результате разукрупнения профессионального союза советских и торговых служащих БССР был образован профессиональный союз работников государственных учреждений БССР. 18-22 апреля 1931 года состоялась  I-ая Всебелорусская конференция профсоюза работников государственных  учреждений, на которой было избрано Центральное правление.  Первым председателем Центрального  правления  избран Башмачников Виктор Владимирович. Местными органами Центрального правления профсоюза работников госучреждений БССР являлись районные месткомы (райместкомы). Райместкомы объединяли профуполномоченных в районных центрах, сельские месткомы и сельских уполномоченных, находящихся на территории района их действия. Численность членов профсоюза в 1933 году составляла 10,8 тыс. человек.
В связи с бурным ростом народного хозяйства и увеличением численности рабочего класса профсоюзы, разукрупненные в 1931 году, вновь выросли в крупные организации. Новое разукрупнение профсоюзов было проведено в 1934 году решением IY пленума ВЦСПС. Профсоюз работников государственных учреждений был разделен на четыре профсоюза:
• - работников госучреждений, который объединял  систему Советов депутатов, Госплана, Управления народно-хозяйственного учета и аппарата советского  контроля; 
• - работников административных учреждений;
• - работников суда и прокуратуры;
• - работников хозяйственных учреждений.
В ноябре 1937 года в соответствии с  постановлением ВЦСПС профсоюз работников госучреждений был объединен с профсоюзом работников административных учреждений, в который входили работники милиции, госбезопасности, исправительных учреждений. В этом же году было принято решение об освобождении военнослужащих от членства в профсоюзе, членами профсоюза могли быть только вольнонаемные работники.
В июне 1941г. в связи с временной оккупацией территории Беларуси немецко-фашистскими захватчиками, деятельность Центрального правления профсоюза работников государственных учреждений БССР была прекращена.
В июне 1944г. деятельность профсоюза работников государственных учреждений была возобновлена. Председателем был избран Макеев Павел Евтихиевич, который работал в этой должности до 1949 года.
В январе 1945 года в состав профсоюза госучреждений вошел профсоюз работников суда и прокуратуры. Численность профсоюза составила 17,8 тыс. человек. К январю 1946 года численность  возросла до 33,5 тыс. человек.
В 1949 – 1950 годах профсоюз возглавлял Антипенко Михаил Ефимович.
С января  1951г. по октябрь 1957г. председателем профсоюза был Берестень Иван Семенович.
В период с 1953 по 1957гг. были созданы Брестский, Витебский, Гомельский, Гродненский и Могилевский областные комитеты профсоюза госучреждений.
21 января 1956г. прошел Объединенный пленум Белорусских комитетов: профсоюза госучреждений и профсоюза финансово-банковских работников, на котором было решено объединить эти два профсоюза в один -  профсоюз работников госучреждений. Председателем вновь был избран Берестень Иван Семенович, секретарем – Богомолов Николай Васильевич. Численность членов профсоюза на начало 1956г. составила свыше 54,6 тыс. человек.
В 1957 году решениями ВЦСПС, ЦК профсоюза работников госучреждений и Белсофпрофа Белорусский Республиканский комитет профсоюза работников госучреждений был ликвидирован. На его базе 17 октября 1957г. был создан Минский областной комитет профсоюза работников госучреждений, который объединил все организации, ранее входившие в Республиканский комитет профсоюза госучреждений.
После ликвидации Республиканского комитета профсоюза структура профсоюзных органов госучреждений перестала соответствовать структуре государственных органов республики. Так, на профсоюзном обслуживании Минского обкома профсоюза госучреждений оказались, кроме профорганизаций низового звена органов государственного управления, и другие коллективы госучреждений республиканского звена, включая и высшие органы государственного управления, такие как: Президиум Верховного Совета БССР, Совет Министров БССР, Госплан БССР, Минфин БССР, Министерство обороны БССР, Министерство внутренних дел БССР и другие. Связь в  деятельности профорганизаций  сверху донизу в республике оказалась нарушенной.
Областные комитеты профсоюза, в связи с переходом в непосредственное подчинение ЦК профсоюза работников госучреждений СССР,  начали терять связь с профсоюзными организациями, что  ухудшало решение экономических и социально-бытовых вопросов и задач, стоящих не только перед профсоюзами, но и руководителями министерств и ведомств.
Учитывая эти и другие важнейшие вопросы жизни и деятельности трудовых коллективов, в феврале 1965г. ВЦСПС, ЦК профсоюза и Белсовпроф приняли решение о возобновлении деятельности Республиканского комитета профсоюза работников госучреждений.
На  I пленуме Республиканского комитета профсоюза 2 июня 1965г. председателем комитета профсоюза была избрана Филиппова Вера  Ивановна,  секретарем  - Сокол Василий Васильевич, работавший председателем Минского обкома профсоюза.
VII пленум  Республиканского комитета профсоюза 12 сентября 1969г.,  в связи с уходом на другую работу Филипповой Веры Ивановны, избирает председателем комитета Румянцеву Зою Михайловну, которая возглавляла профсоюз  до августа 1990 года.
В 1990 году  были созданы самостоятельные отраслевые профсоюзы Беларуси и образована Федерация профсоюзов Беларуси.
27 августа 1990г. пленум Республиканского комитета профсоюза, наряду с рассмотрением отчетного доклада, внес предложение провести I съезд профсоюза работников государственных учреждений и создать самостоятельный профсоюз.
На I съезде профсоюза работников госучреждений, состоявшемся 28 августа 1990 года,  был принят Устав профсоюза работников госучреждений. Председателем республиканского комитета профсоюза  избран Силява Леонид Александрович, заместителем председателя – Шитикова Светлана Александровна.
На II съезде профсоюза работников государственных учреждений, состоявшемся 26 сентября 1995 года, были внесены изменения и дополнения в Устав профсоюза. Претерпело изменение и название профсоюза в связи с тем, что в профсоюзе появились структуры, не имеющие отношения к государственным органам  власти и управления. Профсоюз стал называться «Белорусский профессиональный союз работников государственных и других учреждений».
В период с 26 августа 1999г. по 10 июня  2005г. председателями Белорусского профсоюза работников государственных и других учреждений избирались  Сташкевич Валентин Юльянович, Ярош Вячеслав Никонорович, Заболотный Алексей Евдокимович,  Образов Михаил Евгеньевич.
В 2001 году в  связи с 70-летием профсоюз был награжден Почётной грамотой Национального собрания Республики Беларусь «за значительный вклад в формирование и реализацию социальной политики Республики Беларусь и активную деятельность по обеспечению прав и свобод граждан».
В год 100-летия профсоюзного движения Беларуси работа профсоюзного актива Белорусского профсоюза работников государственных и других учреждений была отмечена высшими профсоюзными наградами: 74 активиста были награждены Почетными грамотами Республиканского комитета; 88 человек – юбилейным знаком «100 лет профсоюзного движения Беларуси»; 7 – юбилейными медалями.
10 июня 2005 года состоялся IY съезд  профсоюза. Председателем профсоюза избран Беляев Александр Михайлович.
На съезде были подведены итоги работы за пять лет. Профсоюз и его организационные структуры  в отчетном периоде  совершенствовали свою деятельность по его организационному укреплению, защите трудовых и социально- экономических прав и интересов членов профсоюза. Особое внимание выборных органов профсоюза было уделено дальнейшему развитию и углублению социального партнерства с государственными органами, организациями, нанимателями, совершенствовались его формы и методы. 
В профсоюзе заключено и действуют  11 тарифных (отраслевых) соглашений: с Министерством внутренних дел Республики Беларусь, Министерством труда и социальной защиты Республики Беларусь, Министерством юстиции Республики Беларусь, Министерством статистики и анализа Республики Беларусь, Министерством финансов Республики Беларусь, Национальным банком Республики Беларусь, ОАО АСБ «Беларусбанк», ОАО «Белпромстройбанк», Унитарным страховым предприятием «Белгосстрах», Республиканским государственно-общественным объединением ДОСААФ, Комитетом по архивам и делопроизводству при Совете Министров Республики Беларусь. Ведётся работа по  заключению отраслевого соглашения с  ОАО «Белвнешэкономбанк».
Заключено более  1040 коллективных договоров, действие которых  распространяется  на 102 тысячи чел. (65% работающих членов профсоюза). Работа профсоюза строится на принципах коллегиальности и единства, совершенствования тактики действия его организации в современных условиях, разъяснения целей и задач, мотивации профсоюзного членства. Проделана значительная работа по сохранению, восстановлению и созданию новых профсоюзных организаций.
Республиканский комитет профсоюза активно работает с молодежью. За высокие показатели в учебе и активную общественную работу в профсоюзной организации для студентов Академии управления при Президенте Республики Беларусь установлено 4 профсоюзные стипендии в размере двух базовых величин каждая.
В Минском финансово-экономическом колледже решением Минского областного комитета профсоюза производится ежемесячная выплата 10 стипендий учащимся в размере одной базовой величины.
Брестским обкомом выплачиваются 2 профсоюзные стипендии учащимся Пинского высшего банковского колледжа.
 
 Съезд  утвердил Программу деятельности профсоюза на 2005-2010 годы,  направленную на:
•  повышение жизненного уровня членов профсоюза за счет совершенствования системы оплаты труда;
•  улучшение условий труда, быта и здоровья работников;
•  развитие и совершенствование системы социального партнерства;
•  участие в разработке и реализации социально-экономической политики государства;
•  внедрение здорового образа жизни, развитие физкультурно-оздоровительной и культурно-массовой работы;
•  воспитание патриотизма и гражданственности, работу с молодежью;
•  организационно-финансовое и кадровое укрепление профсоюза;
•  совершенствование информационной работы;
•  развитие международного сотрудничества профсоюза.